Γονιδιώτες οικοδόμοι;

• Απρίλιος 29, 2024

Πριν από δεκαέξι χρόνια ο κόσμος συναντήθηκε με το πρώτο κλωνοποιημένο θηλαστικό: το πρόβατο Dolly. Πέρα από την έκπληξη ή το φόβο που προκάλεσε εκείνη τη στιγμή, τη λήψη πληροφοριών στο μοριακή βιολογία Έχει επιταχυνθεί με εντυπωσιακό ρυθμό λόγω της ανάπτυξης νέων τεχνολογιών, πιο αποτελεσματικών, ταχύτερων και πιο προσιτών.

Αυτό δημιουργεί ένα μειονέκτημα: πώς να αναλύσουμε και να κατανοήσουμε όλο αυτό τον κόσμο των δεδομένων και των πληροφοριών για την ανίχνευση και επίλυση βιολογικών προβλημάτων; Στην περίοδο ανάπτυξης του γονιδιώματος, οι ερευνητές συνδυάζουν τις εξελίξεις στις γονιδιωματικές επιστήμες και τα μηχανήματα πληροφορικής για τη δημιουργία βάσεων δεδομένων βιολογικών πληροφοριών σε ένα ηλεκτρονικό βιβλίο.

Υπολογιστικοί ειδικοί γονιδιώματος του Κέντρο Γονιδιωματικών Επιστημών του UNAM οδηγούν άλλους επιστήμονες στα βάθη της φύσης ενός οργανισμού. Αποστολή του είναι να βοηθήσει ερευνητές στις μελέτες γονιδίων και γονιδιωμάτων, εκτός από τη μοντελοποίηση και την πρόβλεψη των εννοιών της βιολογίας, όπως η συμπεριφορά ενός κυττάρου.

Ένα από τα μεγαλύτερα επιτεύγματα της ομάδας, με επικεφαλής τον γιατρό Τζούλιο Κολλάδο Βίντις , ήταν η απόκτηση της πλήρους αλληλουχίας του γονιδιώματος του βακτηρίου Escherichia colli, που δημοσιεύθηκε το 1997 στο περιοδικό Επιστήμη , ένα από τα πιο αναγνωρισμένα στον επιστημονικό κόσμο. Μέχρι σήμερα, το κεντρικό έργο του ομίλου είναι η έκδοση του ηλεκτρονικού βιβλίου της φυσιολογίας αυτού και άλλων βακτηρίων.

Η γονιδιωματική είναι η μελέτη του συνόλου των ιδιοτήτων του γονιδιώματος: δομή, αλληλεπίδραση και λειτουργίες των συστατικών του. Το γονιδίωμα είναι το γενετικό υλικό ενός οργανισμού και περιέχει όλες τις πληροφορίες που είναι απαραίτητες για τη δημιουργία και την ανάπτυξη αυτού του όντος και τη μεταφορά των χαρακτηριστικών του από γενιά σε γενιά.

Οι γνώσεις που προέρχονται από τις γονιδιωματικές επιστήμες αυξάνονται καθημερινά. Μόνο περίπου 500 επιστημονικά άρθρα ετησίως παράγονται γύρω από το Escherichia colli. "Είναι ο πιο γνωστός οργανισμός σε μοριακό επίπεδο. Από αυτό γεννήθηκε μοριακή βιολογία », λέει ο πανεπιστημιακός επιστήμονας.

Η ομάδα υπολογιστικής γονιδιωματικής εξετάζει και διατηρεί τα δεδομένα που συλλέγονται στην επιστημονική βιβλιογραφία, τα οποία στη συνέχεια ερμηνεύονται από άλλους ερευνητές.

"Είμαστε επιμελητές, διαβάζουμε άρθρα και εξάγουμε αποδείξεις και ανακαλύψεις, κωδικοποιώντας όλες αυτές τις πληροφορίες σε μια υπολογιστική δομή που μας επιτρέπει να αναπαριστούμε τα κομμάτια του κελιού και τις αλληλεπιδράσεις τους", τονίζει ο Julio Collado.

Άλλοι επιστήμονες είναι υπεύθυνοι για την κατανόηση της σημασίας αυτών των δεδομένων και για την εξαγωγή συμπερασμάτων, όπως η εξήγηση του γιατί οι άνθρωποι και οι μύγες είναι τόσο διαφορετικές αν το γονιδίωμα τους συμπίπτει κατά 60%. ή γιατί πολλά μέλη μιας οικογένειας αναπτύσσουν ορισμένα είδη καρκίνων.

Αντιμετωπίζοντας αυτό το πανόραμα, ο Collado Vides αναρωτιέται ποια είναι η τύχη του βακτηρίου Escherichia colli, ως υποσύνολο βιολογικών γνώσεων που μπορεί να συμβάλει στη γονιδιωματική του μέλλοντος. "Γνωρίζουμε τόσο πολύ για έναν ενιαίο οργανισμό ότι η πρόκληση είναι να ενσωματωθεί όλη η γνώση που δημιουργούν οι επιστήμονες για να αντιπροσωπεύουν τη βιολογική πολυπλοκότητα".

Με την υποδομή πρώτου επιπέδου της Ομάδας Υπολογιστικής Γονιδιωματικής, τα μέλη της αναπτύσσουν μεθόδους πρόβλεψης ρυθμιστικών δικτύων, μεταγραφικών παραγόντων και λειτουργικών συσχετισμών μεταξύ των γονιδίων.

Η επιστήμη συμβάλλει στη βελτίωση της ποιότητας ζωής μας και συμμετέχει στην ατζέντα των πολιτών για την τεχνολογία και την καινοτομία στον τομέα των επιστημών, μια εθνική διαβούλευση στην οποία μπορείτε να επιλέξετε τις προκλήσεις που θεωρείτε ότι πρέπει να αντιμετωπίσει η επιστήμη και η τεχνολογία για να επιτύχει καλύτερη ποιότητα ζωής το 2030 Μπορείτε να ψηφίσετε για την πρόκληση που σας φαίνεται πιο σημαντική: www.agendaciudadana.mx

Ακολουθήστε μας στο @GetQoralHealth, GetQoralHealth στο Facebook και στο YouTube